1. 法律依据：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，县级以上人民政府土地行政主管部门负责本行政区域内土地的管理和监督工作，包括查处违法占地、违法建设等行为。对于集体土地上的工业用地，如果未经批准或者违反批准内容进行建设，就构成了违法建设，应由土地行政主管部门进行查处。2. 查处流程：
- 土地行政主管部门在发现违法建设行为后，会进行调查取证，确认违法事实。 - 随后，会依法作出行政处罚决定，如责令停止建设、限期拆除、罚款等。 - 如果违法建设行为人拒不执行行政处罚决定，土地行政主管部门可以申请人民法院强制执行。3. 特殊情况：
- 在某些地区，可能由于机构改革或职能调整，查处违法建设的职责可能由其他部门（如城市管理综合执法部门）承担。但无论如何，查处违法建设的职责都是明确的，且通常会在地方性法规或政府规章中予以规定。 - 如果违法建设行为同时涉及其他违法行为（如环境污染、安全生产等），则可能还需要其他相关部门（如环保部门、应急管理部门等）的协同查处。4. 法律建议：
- 对于集体土地上的工业用地使用者来说，应严格遵守土地管理法律法规，按照批准的内容进行建设，避免违法建设行为的发生。 - 如果发现违法建设行为，应及时向土地行政主管部门举报，以便及时查处，维护土地管理秩序和公共利益。 总结来说，集体土地上工业用地的违法建设一般由县级以上人民政府土地行政主管部门负责查处。在使用集体土地进行工业建设时，务必遵守相关法律法规，确保建设的合法性和合规性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。