逾期协商机构的收费方式通常是根据催收款项的额度来决定的，这是一种比较常见且合理的收费模式。具体来说，欠款的总金额越大，收费的比例往往会越低。以下是一个大致的收费标准：

- 如果欠款金额在5万元以下，那么协商机构可能会按照欠款额的50%来收费。
- 如果欠款金额在5万元至10万元之间，收费比例可能会降低到40%。
- 而对于10万元以上的欠款，收费比例可能会进一步降低到30%。

需要注意的是，由于逾期协商行业存在一定的风险，因此正规机构的收费通常都不会低于市场价的某个基准，比如20%。所以，在选择逾期协商机构时，债权人应警惕那些报价远远低于市场价的机构，以免陷入价格陷阱或遭遇到不正规的机构。

此外，如果债务人拖欠欠款不还，债权人除了可以选择委托逾期协商机构进行催收外，还可以根据法律规定向法院提起诉讼。在提起诉讼前，债权人需要准备相关的起诉材料和证据，并按照法院的诉讼流程进行操作。

总的来说，逾期协商机构的收费是根据欠款金额和案件难度来决定的，债权人在选择机构时应注重机构的正规性和专业性，并避免陷入不必要的风险。同时，债权人也应了解其他的法律途径来维护自己的权益。