关于“借5000分期1年担保费1000是否合法”的问题，我首先给出结论：是否合法需根据具体情况判断，特别是要看借款利率、担保费率以及综合费用是否超过了法律规定的上限。

接下来，我详细解释这一结论：

1. 利率与费用规定：

- 根据相关法律规定，民间借贷的利率不得超过合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。若超过此标准，则可能被视为高利贷，不受法律保护。 - 担保费是借款人因获得担保而支付给担保人的费用，其合法性主要取决于双方是否自愿达成协议，并且费用是否合理。

2. 具体案例分析：

- 在你的案例中，借款本金为5000元，分期1年，担保费1000元。首先，需要计算借款的年利率（包括利息和担保费等所有费用在内）。 - 假设除担保费外，没有其他额外费用，且借款利息按年利率计算。那么，综合费用（利息+担保费）占借款本金的比例就是（利息+1000）/5000。 - 若这个比例超过了LPR的四倍，那么该借款行为中的综合费用部分就不受法律保护。

3. 法律建议：

- 在借款前，务必仔细阅读借款合同，了解所有费用的明细和计算方式。 - 如果担保费或其他费用过高，可以与借款人协商降低费用或寻求其他借款途径。 - 如遇纠纷，建议及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

综上所述，借5000分期1年担保费1000是否合法，关键在于综合费用是否超过了法律规定的上限。因此，在借款时，请务必注意费用的合理性，并咨询专业律师以确保自己的权益不受损害。如果你有任何进一步的法律问题，可以直接向我咨询。